El Instituto de Ingeniería desarrolla investigación científica y tecnológica propia y docencia en diversas vertientes asociadas con el agua. Los problemas que se abordan están estrechamente relacionados con la ecología, ingeniería hidráulica, mecánica de fluidos y tecnología del medio ambiente, en lo particular orientadas a:
Manejo de fuentes de suministro
Manejo integrado de los recursos hídricos
Recursos costeros y marítimos
Ordenación, manejo y gestión de cuencas hidrográficas